MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120zeta

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003241	A	7	7	1556	1562	100 %	0 %	0 %	0 %	17158062
2	NC_003241	GTAG	2	8	1677	1684	25 %	25 %	50 %	0 %	17158062
3	NC_003241	G	6	6	1688	1693	0 %	0 %	100 %	0 %	17158062
4	NC_003241	CTG	2	6	1718	1723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17158063
5	NC_003241	TCAA	2	8	1731	1738	50 %	25 %	0 %	25 %	17158063
6	NC_003241	T	6	6	1784	1789	0 %	100 %	0 %	0 %	17158063
7	NC_003241	CGG	2	6	2424	2429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17158064
8	NC_003241	GCG	2	6	2449	2454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17158064
9	NC_003241	ATC	2	6	2504	2509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17158064
10	NC_003241	AGAA	2	8	2529	2536	75 %	0 %	25 %	0 %	17158064
11	NC_003241	ATC	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17158064
12	NC_003241	ATAG	2	8	2558	2565	50 %	25 %	25 %	0 %	17158064
13	NC_003241	GAT	2	6	2960	2965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17158065
14	NC_003241	GCA	2	6	3047	3052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17158065
15	NC_003241	TGGG	2	8	3064	3071	0 %	25 %	75 %	0 %	17158065
16	NC_003241	GGCT	2	8	3081	3088	0 %	25 %	50 %	25 %	17158065
17	NC_003241	TGC	2	6	3127	3132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17158065
18	NC_003241	A	6	6	3156	3161	100 %	0 %	0 %	0 %	17158065
19	NC_003241	ATG	2	6	3195	3200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17158065
20	NC_003241	AC	3	6	3228	3233	50 %	0 %	0 %	50 %	17158065
21	NC_003241	TAA	2	6	3327	3332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17158065
22	NC_003241	TGC	2	6	3376	3381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17158065
23	NC_003241	TCA	2	6	3389	3394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17158065
24	NC_003241	ATG	2	6	3408	3413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17158065
25	NC_003241	GAT	2	6	3428	3433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17158065
26	NC_003241	AGT	2	6	3448	3453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17158065
27	NC_003241	TGA	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17158065
28	NC_003241	CAT	2	6	3577	3582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17158065
29	NC_003241	GAA	2	6	3587	3592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17158065
30	NC_003241	AGG	2	6	3650	3655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17158065
31	NC_003241	ACA	2	6	3781	3786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17158065
32	NC_003241	A	6	6	3791	3796	100 %	0 %	0 %	0 %	17158065
33	NC_003241	ATG	2	6	3804	3809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17158065
34	NC_003241	ATAG	2	8	3881	3888	50 %	25 %	25 %	0 %	17158065
35	NC_003241	AC	3	6	3901	3906	50 %	0 %	0 %	50 %	17158065
36	NC_003241	CG	3	6	3923	3928	0 %	0 %	50 %	50 %	17158065
37	NC_003241	CCG	2	6	3944	3949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17158065
38	NC_003241	ACC	2	6	3952	3957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17158065
39	NC_003241	AGG	2	6	4020	4025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17158065
40	NC_003241	AGG	2	6	4050	4055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17158065
41	NC_003241	CGG	2	6	4069	4074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17158065
42	NC_003241	GAT	2	6	4129	4134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17158065
43	NC_003241	AAG	2	6	4172	4177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17158066
44	NC_003241	GT	3	6	4305	4310	0 %	50 %	50 %	0 %	17158066
45	NC_003241	AT	3	6	4418	4423	50 %	50 %	0 %	0 %	17158066
46	NC_003241	ATGAT	2	10	4432	4441	40 %	40 %	20 %	0 %	17158066

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.